Espectrometria de massa

Conductimetría /(S) Abundancia relativa % 100 Tiempo (min) 10 0 1000 1200 1400 1600 1800 m/z 2000 2200 2400 ( ClH 6N, 1 hs a 100ºC) L.G. Barrientos et al. / Biochemical and Biophysical Research Communications 323 (2004) 696–702 Pontes dissulfeto Fosforilação Mistura de proteínas fosforiladas e não fosforiladas Ab digestão em solução IP proteína específica SDS-PAGE LC-MS Excisão da banda e digestão em gel nano LC-MS-MS MALDI-TOF-MS peptide mass fingerprint Identificação da proteína Dificuldades para encontrar peptídeos fosforilados ● Cargas negativas podem diminuir o ataque proteolítico por tripsina. ● A fosforilação pode ser subestequiométrica, de modo que o peptídeo fosforilado está em uma quantidade muito menor que o restante dos peptídeos da molécula. ● A resposta do espectrômetro de massas frente a um fosfopeptídeo pode ser suprimida frente a abundância do mesmo peptídeos não fosforilado. ● A seqüência de aminoácidos nas proximidades de uma fosforilação tendem a ser mais hidrofóbica o que leva a uma perda seletiva dos fosfopeptídeos ao preparar a amostra. ● P-Ser e P-Thr são lábeis e podem se decompor durante a análise. Abordagens para estudar proteínas fosforiladas ● A m/z de uma proteína intacta pode dar uma idéia de quantos fosfatos estão incorporados a mesma ● Um fosfopeptídeo pode ser detectado com MALDI TOF em ambas as suas formas, a fosforilada e a não…

ligações peptídicas em meio alcalino, conseguido na reação através da adição de NaOH. Já no segundo experimento o tubo de ensaio N1 apresentou uma alteração de coloração para cor azul violeta após o aquecimento, já o tubo N2 se manteve inalterável mesmo após o aquecimento. Isso correu devido à presença de aminoácidos, proteínas ou peptídeos na substancia do tubo de ensaio N1, pois a Ninhidrina reage com o grupamento amina, diferentemente da reação de Biureto que reage com as ligações…

para estudar perfis protéicos utiliza técnicas proteômicas atuais baseadas em nano-LC acoplado a espectrômetro de massas de alta resolução (LC-MS/MS), que permitem a identificação de compostos protéicos pouco abundantes. Neste estudo, o comprimento da coluna e do gradiente foram otimizados para análises nano LC-MS/MS do proteoma da peçonha de Bothrops insularis. Para isso a peçonha bruta foi digerida em solução com tripsina e analisada em triplicata técnica via shotgun LC-MS/MS usando…

1. Objetivo Realizar análise qualitativa de frações submetidas ao processo de diálise e identificar em qual (is) há proteína. 2. Procedimento Após um processo de diálise duas frações foram obtidas: 1 e 2. OBSERVAÇÃO: A fração 1 corresponde ao fluido dentro da membrana de diálise, e a fração 2 ao fluido que permeou a membrana em direção à água do recipiente. Em seguida foi recolhida uma amostra de cada fração e submetida a um tratamento com HCl 2N e aquecimento, obtendo-se duas…

Faculdade de Ensino Superior UNIVERSIDADE NORTE DO PARANÁ - UNOPAR Curso: Bacharelado em Educação Física Disciplina: Ciências Moleculares e Celulares Professora: Valéria Aparecida Bello REAÇÕES QUANTITATIVAS PARA IDENTIFICAÇÃO DE PROTEÍNAS Reação de Biureto Murilo Leandro dos Santos Sergio da Silva Serra Tiago Batista dos Santos Londrina- Paraná Abril -2014 REAÇÕES QUÍMICAS DE IDENTIFICAÇÃO DE AMINOÁCIDOS E PROTÉINAS …

Quim. Nova, Vol. 27, No. 5, 781-789, 2004 Revisão SÍNTESES QUÍMICA E ENZIMÁTICA DE PEPTÍDEOS: PRINCÍPIOS BÁSICOS E APLICAÇÕES Alessandra Machado, Cleber W. Liria, Patrícia B. Proti, César Remuzgo e M. Terêsa M. Miranda* Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo, Av. Prof. Lineu Prestes, 748, 05508-900 São Paulo-SP Recebido em 17/9/03; aceito em 27/11/03; publicado na web em 17/6/04 CHEMICAL AND ENZYMATIC PEPTIDE SYNTHESES: BASIC ASPECTS AND…

Ala Val Arg * peptídeo ATG TAT CAT GCC GTT AGG TAG DNA AUG UAU CAU GCC GUU AGG UAG RNAm Met Tir His Ala Val Arg * peptídeo CONSEQUÊNCIAS DAS MUTAÇÕES: • Mutação não sinônima – Sentido trocado (a) TAT CAC GCC GTT AGG TAG DNA AUG UAU CAC GCC GUU AGG UAG RNAm Met (b) ATG Tir His Ala Val Arg * peptídeo ATG TAT CCC GCC …

that schizophrenia is a result of a complex interaction among environmental factors altered gene function and systematic differential protein expression, proteomics is likely to be a suitable tool for studying this disorder. Here we synthetize the main findings by proteomic studies and further directions to be taken in order to better comprehend the biochemistry of schizophrenia as well as reveal biomarkers. In addition, we summarize proteomic methodologies used in such studies.…

INSTITUTO FEDERAL DE EDUCAÇÃO CIÊNCIA E TECNOLOGIA DO ESPÍRITO SANTO CAMPUS DE ALEGRE ALMEIDA, Rafael N. BOLDRINI, Kamilla. LARISSA, Alys. RODRIGUES, Rafael. VAILLANT, Manoel. VEIGA, Yuri. Relatório: Identificação de proteínas em substâncias. Introdução As proteínas são compostos orgânicos de alto peso molecular, e representam cerca de 50 a 80% do peso seco da célula sendo, portanto, o composto orgânico mais abundante de matéria viva. As proteínas incluem as moléculas…

diferentes tipos, desde peptídeos de tamanho relativamente pequeno até enormes polímeros com pesos moleculares na faixa de milhões, podem ser encontrados em uma única célula. A detecção de proteínas em materiais biológicos envolve reações específicas com determinados reativos, os quais originam substâncias coloridas que absorvem luz na região visível, permitindo a sua quantificação. Dentre os métodos utilizados, situa-se o método do biureto, que é baseado na reação do sulfato de cobre…