Genetica analise de cromossomo

Análise evolutiva de uma translocação grande mtDNA (NUMT) em o genoma nuclear das espécies género Panthera
Jae-Heup Kim um, 1, #
, Agostinho Antunes a, b, #
, Shu-Jin Luo uma , Joan Menninger c , William G.
Nash
d
, Stephen J. O'Brien uma E Warren E. Johnson um, * um Laboratório de Diversidade Genômica, National Cancer Institute-Frederick Cancer Research e
Centro de Desenvolvimento (NCI-FCRDC), Frederick, MD 21702-1201, EUA. b REQUIMTE, Grupo de Química Teórica e Computacional - Departamento de Química, Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, Rua do Campo Alegre, 687, 4169-007 Porto, Portugal. c Programa Básico Research, SAIC-Frederick, Inc., NCI Frederick, Frederick, MD, EUA d H & W citogenéticos Services, Inc., Lovettsville, VA, EUA.
Abstract
A translocação de cymtDNA no genoma nuclear, também referido como NUMT, tem sido relatada em muitas espécies, incluindo várias intimamente relacionado com o gato doméstico (Felis catus). Nós descrevemos o transposição recente de 12536 pb de 17 kb do genoma mitocondrial para dentro do núcleo do comum ancestral das cinco espécies do gênero Panthera: Tigre, P. tigris; Snow Leopard, P. uncia; jaguar, P. onca; leopardo, P. pardus; e leão, P. leo. Esta integração nuclear, que representa 74% do genoma mitocondrial, é um dos maiores a ser relatado em eucariotos. O gênero Panthera NUMT difere do NUMT anteriormente descrito no género Felis em: (1) localização cromossómica (F2 - Região telomérica vs. D2 - região centromérica), (2) o gene tornar-se (a partir do ND5 ao ATP8 vs. a partir do RC do COII), (3) de tamanho (kb 12,5 vs. 7,9 kb), e (4) estrutura (monómero único vs. Tandem repetida em Felis). Estas distinções indicam que a origem do fragmento grande NUMT no nuclear genoma da espécie Panthera é uma inserção independente do da linhagem gato doméstico, o qual foi ainda apoiada por análises filogenéticas. O tigre cymtDNA compartilhada em torno de 90% de identidade de sequência com a sequência homóloga