Xanthomonas - Seminário

Panorama de Produção

3ª Cultura com mais área cultivada no mundo;
Cultivada em mais de 120 países;
Ásia detém 90% da produção mundial

China é o maior produtor do mundo com 30% da produção mundial;

O Brasil é o 9º produtor mundial com 2,1%
Rio Grande do Sul maior produtor brasileiro com 62,7% da produção nacional. “Ferrugem ou mancha” do Arroz
 Causada pela bactéria gram-negativa
Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo)
 Manchas bacterianas são as doenças mais sérias do arroz nos trópicos e na Ásia;
 Redução no rendimento da cultura causado por manchas foliares podem ser de até 50%

Interação entre Xoo e arroz
 Seqüências completas do genoma de Xoo foram publicadas para as raças japonesa, coreana e filipinas;
Illumina

 Interações moleculares entre patógeno e mononucleotídeos das plantas.

Seqüenciamento
Illumina
 Seqüenciamento por término reversível:
Genome Analyzer;
3 etapas:
1 – Ligação de adaptadores
2 – PCR em ponte (formação de clusters)
3 - Seqüenciamento

Adição de nucleotídeos não marcados e enzimas

São gerados milhões de clusters de DNA fita simples

O primeiro ciclo de seqüenciamento começa com adição de quatro nucleotídeos marcados reversívelmente, primers e DNA polimerase;

Após excitação com lasers, a fluorescência emitida em cada cluster é capturada por uma câmera e a primeira base é identificada;

O próximo ciclo repete a incorporação de quatro nucleotídeos marcados, primers e DNA polimerase.

Alinhamento de dados

Identificação de fatores relacionados à virulência Genes de resposta (hipersensibilidade e patogenicidade); Produção de exopolissacarídeos (EPS);
Motilidade
Enzimas extra-celulares

Sistemas de secreção
 Tipo II (T2S): secreção de fatores de virulência, tais como enzimas extra-celulares como xylanase.  Tipo III (T3S): Decodificado pelos genes HrP
(hipersensibilidade e patogenicidade), desempenha um importante papel nas interações entre Xoo e o arroz pela injeção de efetores T3 nas células da planta.