Bioinform Tica Arquivo De Dados

Bioinformátic a: Banco de
Dados
Prof. Dra. Adriana Dantas
UERGS, Bento Gonçalves, RS

Introdução
• Tipos de dados relacionados a moléculas pra suporte a pesquisa e aplicações em biologia, agricultura e tecnologias entre outras.
• Conhecer a infraestrutura básica da bioinformática, em termos dos sítios na web
• Conceitos básicos de recuperação de informação, concluindo como formular consultas a banco de dados • Desenvolver habilidades com os instrumentos de pesquisa na web e em sítios específicos
• Aprender a pesquisar por informações especificas sobre sequencias, estruturas, vias metabólicas, e realizar analise com dados recuperados.

Como acessar e recuperar informações dos bancos de
• Tododados? banco de dados é composto por entradas (pacotes discretos e coerentes de informação)

• Um software de recuperação de informação identifica entradas relevantes para o seu interesse
• Para que a pesquisa seja bem-sucedida, seja o mais específico possível • Se você procura uma albumina de galinha..
• Busque por Chicken AND albumin

• Se você for procurar primeiro por Chicken vão aparecer entradas que não contêm informação sobre as albuminas
(perda de tempo)
• Se você procurar por albumin vão aparecer entradas contendo a informação sobre albuminas que não são necessariamente de galinha (perda de informação)

Saiba o quê e aonde você está pesquisando.... • Entrada: E. coli Escherichia coli

• E. Coli – Elisabetta Coli,
Coli pesquisadora do departamento de psiquiatria, farmacologia, neurobiologia e biotecnologia.

Sede por conhecimento
• Talvez você não encontre o que você busca, mas se encontrar.....
• Se encontrou provavelmente vai querer saber mais
• Exemplos:
• Achar genes homólogos ao que você buscou • Referências bibliográficas sobre o gene
• Estrutura da proteína codificada por esse gene Conexão entre os bancos de dados (Interatividade)
• Achar genes homólogos ao que você buscou • Conexão entre entradas do mesmo banco
(banco de dados de genes)
• Referências