Árvores filogenéticas

Análise de Dados em Bioinformática – Prof. Von Zuben
DCA/FEEC/Unicamp

Árvores Filogenéticas
1 Introdução
• todos os fundamentos da biologia moderna estão associados à teoria da evolução de Darwin.
• de aspectos de anatomia, passando por comportamento e chegando à genética, toda a metodologia de análise requer uma apreciação das mudanças nos organismos com o tempo.
• é impossível analisar as relações entre seqüências de genes sem considerar, direta ou indiretamente, o modo como estas seqüências sofreram modificações ao longo do tempo.

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Tópico 6: Árvores Filogenéticas

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2 Taxonomia
• a disponibilidade de seqüências de atributos, que descrevem parte das (não confunda com todas as!) características de organismos, nos remetem às seguintes questões: Y os atributos correspondentes estão devidamente alinhados (sequence

alignment)?
Y uma vez alinhadas, como estas seqüências estão relacionadas?
Y e de um modo geral, uma vez alinhadas, como os organismos dos quais estas

seqüências foram obtidas estão relacionados?
• o estudo dos relacionamentos entre grupos de organismos é chamada taxonomia
(ou taxinomia), a qual representa um dos ramos mais antigos da biologia clássica.
• em outras palavras, a taxonomia envolve a classificação de objetos em grupos, é uma atividade que sempre foi exercida pelos homens de todos os tempos e foi estabelecida como um ramo científico por Carolus Linnaeus (1707-1778).
Tópico 6: Árvores Filogenéticas

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Tópico 6: Árvores Filogenéticas

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• a filogenia ou história evolutiva das espécies está fundamentada em um conceito da teoria da evolução que afirma que grupos com organismos que apresentam atributos similares descendem de um ancestral comum.
• a sistemática filogenética é,