relatorio de biologia estrutural

RELATÓRIO DE BIOLOGIA ESTRUTURAL E DESENHO DE DROGAS
Componentes : Marcelle Debossan , Daisy Azevedo, Maiara Lima e Maysa Barreto

Introdução

Sabe-se que as proteínas são os principais alvos para a criação de fármacos, elas são formadas pela união de aminoácidos através de ligações peptídicas. As diferentes propriedades químicas dos aminoácidos são o resultado das diferentes propriedades dos seus grupos R, a qual é a base para categorizar os aminoácidos como apolar, aromático, polar, positivamente carregado, ou negativamente carregado. Essas propriedades químicas ajudam a caracterizar o tipo de estrutura que a proteína poderá formar.
Existem 4 tipos de organização de estruturas de proteínas.
A estrutura primária irá identificar a seqüência linear dos aminoácidos, enquanto a estrutura secundária mostra a orientação dos aminoácidos a partir de ligações de hidrogênio.
A estrutura terciária é capaz de mostrar a organização tridimensional devido às interações fracas e já a quartenária mostra a interação entre diferentes partes de polipeptídios ou subunidades. Desenvolvimento
Com base nas informações anteriores e o tutorial dado, conseguimos identificar e explorar a proteína cicloxigenase através de seu código PDB(3KK6), pelo site http://www.pdb.org .

Utilizando a ferramenta QuickPDB, foi possível visualizar a estrutura 3D da proteína .

Foi possível a visualização do ligante nesta proteína pela ferramenta ‘’protein workshop’’

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No site http://www.rcsb.org/, identificamos estruturas semelhantes à proteína de interesse, e selecionamos a proteína prostaglandina H2 sintase

Com o programa Rasmol visualizamos a estrutura terciária da proteína prostaglandina H2 sintase semelhante a proteína de interesse.

A cicloxigenase (COX), é uma glicoproteína dimérica integral da membrana, encontrada predominantemente no retículo endoplasmático. Esta enzima