Interação Receptor Ligante

Seminário Interação Receptor-Ligante

CALORIMETRIA DE TITULAÇÃO ISOTÉRMICA

(ITC)

Técnica biofísica usada para determinar parâmetros termodinâmicos de interações bioquímicos

ΔG = ΔH – T ΔS
Entropia
Variação da energia de Gibbs

Entalpia

INTRODUÇÃO:
Fármaco

Podem agir como agentes quimioterápicos por inibir a replicação, a transcrição ou atividade da topoisomerase

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Modos de ligação: Intercalação e Ligação de sulco.

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Intercalação: Muitos mutagênicos encaixam entre o espaço entre dois pares de bases adjacentes, na chamada intercalação. Para que um intercalador encaixe entre pares de bases, as bases têm de se separar, abrindo a cadeia dupla. Isto inibe a transcrição e a replicação do DNA, causando toxicidade e mutações.

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Ligação de sulcos: As duas cadeias de nucleotídeos giram uma sobre a outra e acabam por formar sulcos entre as cadeias de fosfato. A principal função dos sulcos do DNA é fornecer a informação acerca das bases que se encontram ligadas numa determinada região da dupla cadeia sem necessidade de abertura. O sulco maior oferece maior acessibilidade para ligação com proteínas do que o sulco menor.

As reações foram acompanhados por substanciais que causaram alterações da capacidade de calor negativos, o que sugere que as internações hidrofóbicas foram significativas para a formação do complexo .

MODELO HIPOTÉTICO PARA MECANISMO DE LIGAÇÃO

A) Intercalação, requer a formação de uma cavidade de intercalação, seguido pela formação de interações moleculares adicionais (ligações de hidrogênio,
Van der Waals de empilhamento, etc) para ancorar o complexo.
B)Não é necessário nenhuma transição conformacional no DNA.

DADOS TERMODINÂMICOS PARA INTERAÇÃO DROGA-DNA

Resultado do Dataset:
Foram encontrados dados para 10 interações sulco de ligação, 13 interações de monointercalação e 3 reações de bisintercalação.

Fig. 3.
Thermodynamics of drug–DNA binding interactions. 