Dobramento proteico

BQI 600
BIOQUÍMICA GERAL
Termodinâmica do dobramento protéico

1) Significado de conformação protéica Conformação é a denominação dada ao arranjo espacial dos átomos de uma proteína, incluindo qualquer estado estrutural sem romper as ligações covalentes. Entre as numerosas conformações possíveis (as proteínas não são traços rígidos porque suas ligações químicas podem realizar rotação), teoricamente, em uma proteína que contenha centenas de ligações simples, normalmente predominam uma ou algumas em condições biológicas. As proteínas em qualquer de suas conformações enoveladas funcionais são denominadas proteínas nativas. A conformação de uma proteína é estabilizada em grande parte por interações fracas. Cada proteína tem uma estrutura específica que depende de sua estrutura primária, interações químicas resultantes entre as cadeias laterais dos aminoácidos, modificações pós-traducionais e condições do meio em que elas estão inseridas. Resumindo a conformação tridimensional (3D) depende da sequência de aminoácidos, a função depende da estrutura, cada proteína existe em um ou em pequeno número de formas estruturalmente estáveis e as principais forças para a estabilização de estruturas são forças não-covalentes (pontes de hidrogênio, interações iônicas, interações hidrofóbicas e de Van der Waals).

Conformação refere-se à estrutura tridimensional de uma molécula decorrente da somatória de ligações fracas, não covalentes.
Configuração refere-se à estrutura tridimensional de uma molécula determinada por ligações covalentes, como por exemplo, as formas L- e D- de um aminoácido.

2) A variação de energia livre entre os estados nativo e ao acaso das proteínas Conformação nativa de uma proteína refere-se à estrutura tridimensional em que a molécula apresenta suas propriedades biológicas naturais. Apresenta, conformação existente sob determinado conjunto de condições é termodinamicamente mais estável, tendo a menor energia livre de Gibbs(G). As