graduando

UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO DE JANEIRO
DISCIPLINA
BIOINFORMÁTICA
PROFESSOR: DIEGO ENRY B. GOMES

TRABALHO DE BIOINFORMÁTICA

ALUNOS: DANIEL GUERRA E KARINA CARUSO 5° PERÍODO/ANO: 2013/N°: 111299922/111279689

Rio de Janeiro
Setembro de 2013

1) - Qual a espécie de Drosophila que possui uma sequência gênica mais próximo do hunchback? Quais os parâmetros do alinhamento?
A espécie de Drosophila que possui a sequência gênica mais próximo do Hunchback é a Drosophila sechellia hunchback gene region. Parâmetros - Maximo de sequencias-alvo:100, Limiar esperado:10, Sequencias de entrada pequenas, Word size:28, Pontuação para matches e mismacthes:1-2
2) - Qual a espécie de Drosophila que possui uma sequência de aminoácidos mais próximo do hunchback? Quais os parâmetros do alinhamento?
A espécie de Drosophila que possui uma sequência de aminoácidos mais próximo do hunchback é a hunchback [Drosophila sechellia]. Parâmetros - Maximo de sequencias-alvo:100, Limiar esperado:10, Sequencias de entrada pequenas, Word size:28, Pontuação para matches e mismacthes:1-2
3) - Compare os dois resultados acima.
Comparando os resultados é possível analisar que a origem genica da drosophila sechellia e melanogaster pode ter sido proveniente de um ancestral comum entre elas, já que tanto as suas sequencias genicas e de aminoácidos são próximas uma da outra.
4) - Buscar a sequência do gene hunchback em Drosophila melanogaster
>gi|56411841:c4524569-4515675 Drosophila melanogaster chromosome 3R, complete sequence
AACTCTGATCCATACAAATAATAAGTTATCCTTTTGTATTGTATAGAGAAAAAAAGGTTT-
TTACCAATGA
ACTATGAATAATGAATAATAATAATAGTTTTTTTTTTTAGTCCAAAATTTGTCATTAAAC-
CTAGTTAGAA
CAATCGCTCCTAATTTATCATTCTAAAAGCGAACATTCCGCTTGGGAAAAAAATTGGTCT-
AAACCGAATG
ATACTATTAATGATATGCATTTATTGCTAACCATAATCCTTGTCAAGCTAACAATGATAC-
ATTTTCCGAA
ATTAGCTTAAAAAGGTGGAATACACCCAATATGCACAAACTACCTTAAGGAGATTTGGAA-
TTTCGAATGC