Genoma

Genoma
1. Estrutura e organização do gene Inicialmente convém estabelecer o que entendemos por gene. Numa concepção simplista podemos admitir que um gene é o segmento de DNA que codifica uma certa proteína. Embora esta definiçao possa ser útil e válida, ela encontra dificuldades de aplicação quando o segmento de DNA contém introns. Por outro lado, convém em muitos casos considerar as regiões controladoras da expressão do gene como partes integrantes dele. Assim, a definição molecular de gene deve compreender um segmento de DNA bem maior do que o mínimo necessário para codificar os aminoácidos que fazem parte da sequência polipeptídica. Vamos começar o caminho na direção da definição molecular de um gene pela análise da estrutura típica de um gene procarioto. Embora em muitos casos vários genes estejam sob o controle de um único sistema, formando o chamado operon, vamos aqui considerar que um único gene está em jogo. A figura abaixo mostra um gene típico de um procarioto.

Figura 1: Estrutura típica de um gene procarioto. RBS = sítio ligador de ribossomo; ATG = códon de iniciação da síntese protéica; Cds ou ORF = quadro aberto de leitura; stop = qualquer um dos três códons de finalização da síntese proteica; terminador = região terminadora da transcrição O trecho compreendido entre o códon de iniciação da síntese proteica (usualmente ATG ou TTG) e um dos três códons para terminação da síntese proteica (designados aqui por stop) determina a sequência de aminoácidos do polipeptídeo final, produto do gene. Este trecho é frequentemente designado como quadro aberto de leitura (ORF = open reading frame) ou sequência codificadora (Cds = coding sequence). Antes dele (diz-se 5' dele) estão o promotor (onde vai se ligar a RNA polimerase) e o sítio ligador de ribossomo (RBS = ribosome binding site ou rrs = ribosome recognition site), uma sequência que, quando transcrita para o mRNA, irá permitir o pareamento deste com um trecho complementar do RNA 16 S da sub-unidade