Bacharel

UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO
FACULDADE DE FILOSOFIA, CIÊNCIAS E LETRAS DE RIBEIRÃO PRETO
DEPARTAMENTO DE FÍSICA E MATEMÁTICA
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM FÍSICA APLICADA À MEDICINA E BIOLOGIA

Otimização de um cluster de alto desempenho para o uso do programa PGENESIS em simulações biologicamente plausíveis em larga-escala de sistemas neurais

Vladimir Fabrício Pereira de Carvalho

Orientador: Prof. Dr. Antônio Carlos Roque da Silva Filho

Dissertação apresentada à Faculdade de
Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão
Preto da USP, como parte das exigências para a obtenção do título de Mestre em
Ciências, Área: Física Aplicada à
Medicina e Biologia.

Ribeirão Preto – SP
2007

Pereira de Carvalho, Vladimir F.
Otimização de um cluster de alto desempenho para o uso do programa
PGENESIS em simulações biologicamente plausíveis em larga-escala de sistemas neurais./Vladimir Fabrício Pereira de Carvalho. - Ribeirão
Preto, 2007. 101 p.
Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de
Ribeirão Preto, 2007.
Orientador: Prof. Dr. Antônio Carlos Roque da Silva Filho.
1. Clusters de computadores. 2. Simulação computacional

Dedico este trabalho ao meu padrinho que partiu cedo demais.

AGRADECIMENTOS
Agradeço ao meu orientador professor Roque pela paciência, apoio, oportunidade e imensurável ajuda.
Aos meus pais Antonio Carlos e Magali pelo incentivo incondicional e por nunca terem deixado que eu sequer cogitasse a desistência.
A minha amada esposa Claudia, pela força “extra” em todas as etapas e por ser a grande incentivadora do meu crescimento acadêmico, profissional e pessoal.
Aos irmãos Vanderson, Vitor e Vanessa pelos momentos em família.
Aos irmãos de velha data Douglas, Ivan, Renato, Edvaldo, Marcelo, Zé e Tio pela descontração nos momentos de escape e pelo entendimento da ausência nestes últimos tempos.
Aos meus avôs Antonio e Geraldo e avós Zulmira e Maria que serviram de modelo de perseverança.
Aos