Apostila r

Universidade Estadual Paulista Programa de Pós-Graduação Biologia Animal

Estatística aplicada à ecologia usando o R

Professores responsáveis: Diogo Borges Provete ([e-mail]) Fernando Rodrigues da Silva ([e-mail]) Thiago Gonçalves Souza ([e-mail]) São José do Rio Preto, SP Abril, 2011

SUMÁRIO Objetivo do curso O que você não encontrará nesta apostila Introdução: integrando questões ecológicas e análises estatísticas O melhor caminho para fazer a pergunta certa Introdução ao ambiente de programação R Baixando e instalando a versão base do R Porque usar o R O “workspace” do R e o Tinn-R Os tipos de objeto: criação e manipulação Operações aritméticas básicas Entendendo o arquivo de ajuda Instalando e carregando pacotes Importação e exportação de dados Criação e manipulação de gráficos no R Distribuições estatísticas Funções de probabilidade Funções de distribuição acumulada Distribuição binomial Distribuição Poisson Distribuição Normal Modelos Lineares Generalizados Curva de acumulação de espécies 4 5 6 8 9 10 10 11 12 15 16 17 18 20 18 23 24 24 28 32 36 65 2

Estimadores de riqueza Índices de diversidade e diversidade beta (β) Introdução à estatística multivariada Leitura recomendada

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OBJETIVO DO CURSO Esta apostila foi elaborada para servir como material de apoio para um curso ministrado

no PPG Biolgia Animal da UNESP de S.J. Rio Preto. Nossa proposta com o curso e com esta apostila é de traçar o melhor caminho (pelo menos em nosso ponto de vista) entre questões ecológicas e os métodos estatísticos mais robustos para testá-las. Guiar seus passos nesse caminho (nem sempre linear) necessita que você utilize um requisito básico: o de utilizar seu esforço para caminhar. O nosso esforço, em contrapartida, será o de segurar suas mãos, mantêlo de pé e indicar as melhores direções para que adquira certa independência em análises ecológicas. Todo o material utilizado durante este