Análise de sequência de dna

ANÁLISE DE SEQUÊNCIA DE DNA:
Danielle Forbeci Suzuki
Pamella Hachbardt

O presente artigo propõe a análise de sequência de um fragmento de DNA fornecido de um procarioto. Com o auxílio da ferramenta computacional BLASTP foi possível visualizar e estudar as características inerentes a este organismo e através do sequenciamento do seu gene e identificação de suas ORF’s foi encontrada a proteína codificada Urease acessory. O produto desse gene está amplamente encontrado em vegetais, bactérias e fungos e apresenta um alto grau de homologia entre si. A sequência de DNA que codifica essa proteína foi composta por 891 pares de bases e possui a porcentagem de G+C na terceira base de 80.1%. Esta similaridade de sequência primária indica um processo conservativo durante a evolução da espécie e um papel fisiológico importante destas enzimas. Na análise de vizinhança do gene encontramos outros três organismos similares, dentre eles o Brucella abortus, transmissor de zoonoses e responsável por problemas sanitários e econômicos nas áreas de produção de carne e leite. (Poester et al. 2002).

Palavras-chave: gene, Urease acessory, Brucella abortus, sequenciamento.

1 INTRODUÇÃO

1.1 A importância em se conhecer a sequência de um gene

A descoberta da estrutura do DNA, molécula que armazena a informação genética, pelos pesquisadores Watson e Crick em 1953, levou a biologia molecular, principalmente a partir da década de 1990, a se tornar uma grande propulsora da Bioinformática, ciência que integra as áreas de Biologia, Bioquímica e Informática. Com o auxílio da Bioinformática, que se destaca na busca de conhecimento para desenvolver novos métodos de análise integrada de dados, pode-se isolar e seqüenciar moléculas de DNA de maneira rotineira. A otimização das técnicas de sequenciamento leva ao desenvolvimento de ferramentas com o objetivo de sequenciar genomas completos de diferentes organismos, assim como se torna uma forma de explorar e processar dados