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Peptídeos e Proteínas

[Antigo dogma = Um gene, uma proteína]  [Novo Dogma = uma gene uma cadeia polipeptídica]. Isso porque uma proteína pode conter mais de uma cadeia polipeptídica, podendo ser iguais ou diferentes. E ser codificada por mais de um gene.
A sequência de aminoácidos codificada no DNA já defina qual e estrutura tridimensional da proteína.
Cada cadeia polipeptídica é um polímero de aminoácidos ligados covalentemente, depois interações fracas ocorrem definindo os níveis de organização de cada proteína e, eventualmente, algumas outras ligações covalentes.
Estrutura Primária = Aminoácidos ligados entre si formando uma cadeia polipeptídica. E a sequência que é definida geneticamente, sendo específica para cada proteína.

Ligação Peptídica = Os aminoácidos estão ligados pelas ligações peptídicas, que é uma reação de desidratação, entre duas ligações covalentes, onde o Carbono da carbonila do ácido carboxílico é um centro deficiente em elétrons, pois a nuvem eletrônica está deslocada para o oxigênio e o Nitrogênio do grupo amino é um centro de excesso de elétrons, pois tem um par livre. Então o grupo amino de um aminoácido faz um ataque nucleofílico no carbono de outro aminoácido que libera um OH-(elétron do carbono vai junto) e do amino sai H+, daí a formação de água. Caso não houvesse esse ataque haveria a liberação de radicais livres e não de íons, que são muito reativos e atrapalhariam a reação. Então o carbono do ácido fica com carga positiva e o amino fica com carga negativa, formando a ligação peptídica, que é uma amida.
Na verdade, a ligação peptídica não é 100% covalente, pois o comprimento de ligação dela é intermediário entre O=N e O-N, o que analogamente ao benzeno, tem um fenômeno de ressonância, onde a ligação dupla fica se alternando entre O=O e C=N. Essa configuração faz a ligação peptídica se configure como um plano rígido (plano amida), ou seja, o carbono e o nitrogênio da ligação não têm livre rotação.

Proteínas e Peptídeos são feita