Rna de interferência

processamento perfeito, gerando um siRNA de 21 nt exato para o off-target. As chances disto acontecer são de 1 em 21. Assim sendo, em um exemplo simples, os efeitos de off-targeting neste caso são de apenas 1/100 x 1/21 isto é 0,0476 %. Considerando a estabilidade termodinâmica do siRNA isso pode cair para zero (vide capítulo 3 - Strand Analysis 1.0). O calcanhar-de-aquiles pode ser superado inesperadamente caso se desenvolva uma estratégia que torne os siRNAs totalmente gene-específicos, seja por modificação de sua estrutura molecular ou por outros meios. Na terapêutica, é possível ainda que o “fator de diluição” diminua eventuais problemas, ou que, mesmo havendo um real off-targeting, os custos (efeitos colaterais) dos siRNAs valham o benefício: a cura. 42 3. Bibliografia Amarzguioui M, Prydz H. (2004). An algorithm for selection of functional siRNA sequences. Biochem Biophys Res Commun. 316(4):1050-8. Anandalakshmi R, Marathe R, Ge X, Herr JM Jr, Mau C, Mallory A, Pruss G, Bowman L, Vance VB. (2000). A calmodulin-related protein that suppresses posttranscriptional gene silencing in plants. Science. 290:142-4. Bergstrom CT, McKittrick E, Antia R. (2003). Mathematical models of RNA silencing: unidirectional amplification limits accidental self-directed reactions. Proc Natl Acad Sci U S A. 100(20):11511-6. Bernstein, E, Caudy, AA, Hammond, SM and Hannon, GJ. (2001). Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference.…

processamento perfeito, gerando um siRNA de 21 nt exato para o off-target. As chances disto acontecer são de 1 em 21. Assim sendo, em um exemplo simples, os efeitos de off-targeting neste caso são de apenas 1/100 x 1/21 isto é 0,0476 %. Considerando a estabilidade termodinâmica do siRNA isso pode cair para zero (vide capítulo 3 - Strand Analysis 1.0). O calcanhar-de-aquiles pode ser superado inesperadamente caso se desenvolva uma estratégia que torne os siRNAs totalmente…