NCBI BLAST: REVISÃO NCBI BLAST: REVISÃO NCBI BLAST: short review

NCBI BLAST: REVISÃO Bioinformática

Maceió, 27 de julho de 2013

INTRODUÇÃO Do início até meados do século passado os geneticistas e químicos se questionaram sobre a natureza química do material genético. Das pesquisas desenvolvidas, surgiu a conclusão de que o DNA era a molécula que armazenava a informação genética e, em 1953, sua estrutura química foi desvendada no clássico trabalho de Watson e Crick. Com a posterior descoberta do código genético e do fluxo da informação biológica, dos ácidos nucléicos para as proteínas, tais polímeros passaram a constituir os principais objetos de estudo de uma nova ciência, a Biologia Molecular. Logo surgiram métodos de sequenciamento desses polímeros, principalmente do DNA, que permitiam a investigação de suas sequências monoméricas constituintes. Desde então, mais de 18 bilhões dessas sequências já foram produzidas e estão disponíveis nos bancos de dados públicos.
Na segunda metade da década de 90, com o surgimento dos seqüenciadores automáticos de DNA, houve uma explosão na quantidade de seqüências a serem armazenadas, exigindo recursos computacionais cada vez mais eficientes. Além do armazenamento ocorria, paralelamente, a necessidade de análise desses dados, o que tornava indispensável a utilização de plataformas computacionais eficientes para a interpretação dos resultados obtidos. Assim nascia a bioinformática.

NCBI BLAST
BLAST é um acrônimo para Básico Local Alignment Search Tool, e é o nome dado a um conjunto de ferramentas para a identificação de correspondências imperfeitas entre uma dada sequência de consulta e um banco de dados de sequências. Também, Os programas BLAST são amplamente utilizados como ferramentas de Pesquisas em bancos de dados de