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UNIVERSIDADE FEDERAL DE JUIZ DE FORA
INSTITUTO DE CIÊNCIAS EXATAS
DEPARTAMENTO DE CIÊNCIA DA COMPUTAÇÃO

Relatórios Técnicos
do Departamento de Ciência da Computação
da UFJF
n° 01/2012

SERVIÇOS WEB BIOLÓGICOS

Magnus Teixeira Ribeiro

Departamento de Ciência da Computação
UNIVERSIDADE FEDERAL DE JUIZ DE FORA

Relatórios Técnicos do DCC/UFJF, No. 01/2012
Julho, 2012SERVIÇOS WEB BIOLÓGICOS
Magnus Teixeira Ribeiro
NenC - Núcleo de Pesquisa de Engenharia do Conhecimento Departamento de Ciência da Computação
Universidade Federal de Juiz de fora
dignus07@gmail.com

Abstract. This paper presents a brief description of key features and functionality of
some web services from the European Bioinformatics Institute (EBI) part of the European
Molecular BiologyLaboratory (EMBL). The study of these services with enteresse in
discovering the mechanisms of its structure, thereby facilitating the understanding of the
possible data you enter and out, their parameters and their answers.
Keywords: bioinformatics, web services.
Resumo. Este trabalho apresenta uma breve descrição da principais
características, e funcionalidades de alguns serviços web doEuropean Bioinformatics
Institute (EBI) parte do European Molecular biology Laboratory (EMBL). O estudo
desses serviços com enteresse em descobrir os mecanismos de sua estrutura, facilitando
com isso, o entendimento das possíveis entradas e saídas de dados, seu parametros e
respectivas respostas.
Palavras-chave: Bioinformática, serviços web.

ii

SumárioABSTRACT..............................................................................................................................................II
RESUMO..................................................................................................................................................IISUMÁRIO...............................................................................................................................................III
LISTA DE FIGURAS..............................................................................................................................IV
1.0 - INTRODUÇÃO ................................................................................................................................5
2.0 - FORMATOS DE SEQUÊNCIA DE NUCLEOTÍDIOS EPROTEÍNAS........................................7
2.1 - O FORMATO FASTA......................................................................................................................7
3.0 - ALINHAMENTO, SIMILARIDADE, HOMOLOGIA....................................................................8
3.1 - ALINHAMENTOGLOBAL............................................................................................................9
3.2 - ALINHAMENTO LOCAL...............................................................................................................9
3.3 - ANALISE DOS RESULTADOS DO ALINHAMENTO...............................................................10
3.4 - BLAST E SEUS SUBPROGRAMAS.............................................................................................10
3.5 -ALINHAMENTOS ÓTIMOS E HEURÍSTICOS...........................................................................11
3.6 - MATRIZES DE COMPARAÇÃO..................................................................................................11
4.0 – DESCRIÇÃO DOS SERVIÇOS.....................................................................................................12
4.1- CLIENTE DO SERVIÇOWEB: UNIPROT.ORG............................................................12
4.1.1-COMO USAR A FERRAMENTA UNIPROT.ORG.........................................12
4.2 - CLIENTE DO SERVIÇO WEB:NCBI BLAST................................................................19
4.2.1 - COMO USAR A FERRAMENTA NCBI BLAST...........................................19
4.3-CLIENTE DO SERVIÇO WEB:...
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