Introdução À bioinformática

Introdução à Bioinformática
Ronaldo Rodrigues Ferreira
Centro de Biologia Genômica e Molecular (PUCRS)
Instituto de Informática (UFRGS)

Uberaba, junho de 2005

Objetivos

O que é Bioinformática
● Bioinformática versus Biocomputação
● Diálogo entre biólogos moleculares e cientistas da computação
● Bioinformática: proteômica e genômica
● A Bioinformática no Brasil – caso Genesul
● A Bioinformática e a iniciativa privada
● Sequenciamento de genomas: técnicas e equipamentos
● Bases de Dados biológicos
● Anotação de Genomas
● Softwares
● Principais locais de pesquisa no Brasil em Bioinformática
● Congressos
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O que é
Bioinformática

Desenvolvimento de ferramentas e métodos computacionais para análise, manipulação, construção, edição e gerenciamento de dados biológicos.
Análise em laboratório de dados biológicos é difícil e custosa.
Portanto, técnicas computacionais são essenciais [1].

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[1] Machine Learning Approaches to Gene Recognition
Mark W. Craven and Jude W. Shavlik
IEEE – AI in Molecular Biology (1994)

Bioinformática versus Biocomputação

“... Or to come right to the point, how do we train bacteria to make transistors?”
Seymour Cray pai do supercomputador [2]

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[2] FORBES, Nancy / Imitation of Life: How Biology is
Inspiring Computing / MIT Press (2004)

Diálogo entre biólogos moleculares e cientistas da computação

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Falta de uma formação multidisciplinar
Objetos de estudo diferentes

Bioinformática:
Proteômica e Genômica

Proteômica ou Bioinformática Estrutural:
Predição de estrutura de proteínas
● Visualização 3D de estruturas protéicas
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Genômica:
Análise, edição, manipulação de Genomas
● Banco de Dados biológicos
● Genômica funcional
● Anotação de genomas
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A Bioinformática no
Brasil: caso Genesul

Começou como uma iniciativa da Coopercitrus e Fapesp com o objetivo de sequenciar o genoma completo da
Xylella fastidiosa.